摘要：病原基因組信息的匱乏是牡蠣病害研究進展緩慢的主要原因之一。為鑒定更多牡蠣相關病毒，基于前期研究獲得的華南沿海多地養(yǎng)殖的香港牡蠣(Crassostrea hongkongensis)病毒組測序數(shù)據(jù)進行質(zhì)控、組裝、物種注釋后，挑選出其中疑似圓環(huán)病毒基因組序列進行進化樹構建、基因組比較、蛋白結構域分析、三維結構預測和病毒豐度分析，在養(yǎng)殖牡蠣體內(nèi)鑒定到了5個序列完整的新型牡蠣相關圓環(huán)病毒基因組，且5個病毒基因組在多個樣品中存在。結果顯示，5條病毒序列與已知的圓環(huán)病毒聚類在一個大的分支，說明其為圓環(huán)病毒科成員；5條病毒基因組序列均含有一個復制酶蛋白基因，且均與節(jié)肢動物圓環(huán)病毒復制酶蛋白序列最為相似；5條序列與另外7條公共數(shù)據(jù)庫檢索到的序列形成了一個獨立的子分支，且該分支的序列來源多為動物相關樣品。基于結構域分析軟件(SMART)鑒定到多數(shù)序列中存在復制酶的保守結構域。
